《黑暗物质》是由一系列很长的故事组成的，整个故事发生在一个和我们的地球很相似的世界里，讲的是一对名叫莉拉和威尔的少年的旅行和冒险经历，不仅围绕孩子，还涉及清白、原罪以及融合了魔幻、科学等元素。第一部《黄金罗盘》中莉拉为了拯救她最好的朋友罗杰而前往危险重重的极北之地，在那里她还将尽全力帮助其他被诱拐的孩子逃离成为邪恶科学家试验品的厄运。第二部《精工小刀》讲的是莉拉遇到了一个从地球出逃的男孩威尔，在两人成为密友后却发现了一个致命的秘密。在第三部《琥珀望远镜》里，莉拉和威尔穿梭于各个不同的空间，故事的结局是两人携手开始了对一个最不可知秘密的探索之旅。 本片讲述的是一位叫莉拉·贝拉奎亚(Lyra Belacqua)的早熟小女孩，前往一座平行宇宙搭救被黑暗势力绑架的朋友，与各种异形生物、巫婆和其他人物遭遇的故事。